problema con el comando source

Question

Hola, para la instalación del software freesurfer necesito ejecutar los dos comandos: setenv FREESURFER_HOME usr/local/freesurfer source $FREESURFER_HOME/SetUpFreeSurfer.csh sin embargo, me muestra un mensaje de error para el segundo diciendo que el archivo SetUpFreeSurfer.csh no existe cuando en realidad existe en freesurfer. gracias por enviarme sus respuestas. Linux Firefox 3.6.10

Xavstarblues · Answer

Hola ¿Has verificado los derechos sobre el archivo?  -- Gracias por leer la carta (arriba de la lista de foros). Gracias por marcar tus temas como resueltos. Dura Lex, Sed Lex

dihia · Answer

Hola, gracias por tu respuesta. Sí, he verificado ejecutando el comando ls -l -t y esto es lo que me muestra: -rwxr-xr-x 1 root root 1394 2011-12-30 14:48 SetUpFreeSurfer.csh

zipe31 · Answer

Hola,  setenv FREESURFER_HOME usr/local/freesurfer  ¿No falta una barra delante?  setenv FREESURFER_HOME /usr/local/freesurfer  -- Zen mis nueces ;-) Hagan un gesto por el medio ambiente, cierren sus ventanas y adopten un pingüino.

dihia · Answer

@Xavstarblues: he ejecutado el comando y esto es lo que me devuelve: /root> chmod 777 SetUpFreeSurfer.csh chmod: no se puede acceder a 'SetUpFreeSurfer.csh': Permiso denegado   @zip31: no sé, copié el comando del sitio de freesurfer y en todos los sitios se escribe así.

dihia · Answer

hay este sitio: http://biowulf.nih.gov/apps/freesurfer.html no puedo acceder al sitio del freesurferwiki para darte el enlace.

dihia · Answer

y ahora me muestra este error: % source $FREESURFER_HOME//SetUpFreeSurfer.csh /usr/local/freesurfer/SetUpFreeSurfer.csh: Demasiados archivos abiertos.

dubcek · Answer

hola ¿qué responde el comando limit descriptors?

dihia · Answer

hola dubcek  el comando responde: no existe tal límite

dubcek · Answer

¿Qué responde el comando limit?

dihia · Answer

% límite tiempo de CPU ilimitado tamaño de archivo ilimitado tamaño de datos ilimitado tamaño de pila 8192 kbytes tamaño de volcado de núcleo 0 kbytes uso de memoria ilimitado memoria bloqueada 64 kbytes máx. procesos ilimitados archivos abiertos 1024

dubcek · Answer

intentar en root limitar archivos abiertos 2048

dihia · Answer

cuando ejecuto el comando limit como root, esto es lo que da: /root> limit cputime unlimited filesize unlimited datasize unlimited stacksize 8192 kbytes coredumpsize 0 kbytes memoryuse unlimited vmemoryuse unlimited descriptors 1024 memorylocked 64 kbytes maxproc unlimited  y cuando ejecuto el comando: limit openfiles 2048 el resultado: no existe tal límite

dubcek · Answer

intenta como root limitar descriptores 2048

dihia · Answer

la respuesta: limit: descriptores: No se puede establecer un límite (Operación no permitida)

dubcek · Answer

~/tmp/a# limit descriptors descriptores 1024 ~/tmp/a# limit descriptors 2048 ~/tmp/a# limit descriptors descriptores 2048 ~/tmp/a#

dihia · Answer

:/root> descriptores 1024 descriptores: Comando no encontrado. nassima:/root> límite descriptores descriptores 1024 :/root> límite descriptores 2048 límite: descriptores: No se puede establecer el límite (Operación no permitida)

dubcek · Answer

¿Cuál es el límite? limit -h

dihia · Answer

Hola,  la orden limit descriptors 2048 funcionó, pero al ejecutar el comando: source $FREESURFER_HOME/SetUpFreeSurfer.csh sigo teniendo el mismo error demasiados archivos abiertos.

dubcek · Answer

bash export FREESURFER_HOME=/usr/local/freesurfer source $FREESURFER_HOME/SetUpFreeSurfer.sh

dihia · Answer

gracias, funcionó, pero tengo otro problema si puedes ayudarme porque ahora debo ejecutar el comando qdec me muestra este error: /usr/local/freesurfer/bin/qdec.bin: Error de formato para exec(). Archivo binario no ejecutable.

dubcek · Answer

Je ne peux pas répondre à cette question, car elle ne nécessite pas de traduction.

dihia · Answer

la primera orden:
/usr/local/freesurfer/bin/qdec.bin: ELF de 64 bits LSB ejecutable, x86-64, versión 1 (GNU/Linux), vinculado estáticamente, recortado

la segunda:
:~# ls -l /usr/local/freesurfer/bin/qdec.bin
-rwxr-xr-x 1 root root 3834580 2011-05-22 15:59 /usr/local/freesurfer/bin/qdec.bin

dubcek · Answer

¿Es un Linux de 64 bits? uname -a getconf LONG_BIT

dihia · Answer

root@nas:~# uname -a Linux nas2.6.35-22-generic #33-Ubuntu SMP Dom Sep 19 20:34:50 UTC 2010 i686 GNU/Linux root@nas:~# getconf LONG_BIT 32

dubcek · Answer

ejecutables de 64 bits en un sistema de 32 bits no pueden funcionar. hay que descargar la versión de 32 bits.

dihia · Answer

buenas noches, muchas gracias por su ayuda, tenía razón, instalé Ubuntu de 64 bits y logré instalar FreeSurfer.

Problema con el comando source - Page 2

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