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Grep sur fichier volumineux

Résolu/Fermé
userette - 22 avril 2009 à 18:16
 userette - 23 avril 2009 à 18:03
Bonjour,
J'ai un fichier très volumineux à parcours.
Je voudrais que ma commande grep sorte à la première occurrence trouvée.
Sinon mon script mettrait des jours à se terminer puisque qu'il parcourt à chaque grep touuuuut le fichier.

je sais qu'il y a l'option grep -m NUMBER
mais elle est pas reconnue sur ma machine. peut etre ancienne version.



SVP aidez moi. je bloque la-dessous.
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16 réponses

Réponse 1 / 16
jipicy Messages postés 40842 Date d'inscription jeudi 28 août 2003 Statut Modérateur Dernière intervention 10 août 2020 4 897
22 avril 2009 à 18:30
Salut,

Tu peux afficher :
grep --version
grep --help
Sinon avec "sed" : 
sed -n '/motif/p;q' fichier
;-))
0
userette
22 avril 2009 à 18:50
merci pour ta réponse.
j'ai essayé avec sed.
ça me renvoie pas d'erreur sauf que ça ne me renvoie rien du tt.


sed -n '/MOTIF/p;q' File

alors que si je fais sed -n '/MOTIF/p' File --> ça me renvoie une ligne.

aurais-tu une idée? est ce qu'il faut forcer l'affichage?
0
Réponse 2 / 16
jipicy Messages postés 40842 Date d'inscription jeudi 28 août 2003 Statut Modérateur Dernière intervention 10 août 2020 4 897
22 avril 2009 à 18:59
C'est bizarre ça ;-\

Et comme ça :
sed -n '/MOTIF/{p;};q' File
???
0
userette
22 avril 2009 à 19:02
oui ça marche mais ça parcoure qd meme tout le fichier :(
t'aurais pas une autre idée stp ?

je bloque :(
0
Réponse 3 / 16
jipicy Messages postés 40842 Date d'inscription jeudi 28 août 2003 Statut Modérateur Dernière intervention 10 août 2020 4 897
22 avril 2009 à 19:04
On peut avoir un bout de ton fichier et le motif à chercher please ?
0
userette
22 avril 2009 à 19:09
bout du fichier :

21621623335704|17|
21621623336802|17|
21621623351963|17|
21621623357067|17|
21621623373862|17|
21621623376968|17|
21621623390324|17|
21621623391903|17|
21622010039|14|
21622010077|16|
21622010191|36|
21622010275|16|
21622010352|16|
21622010405|18|
21622010547|14|
21622010664|37|
21622010692|17|
21622010709|36|
21622010720|17|
21622010737|17|
21622010822|37|
21622010944|36|
21622011017|14|

le motif à chercher : 21622010039 par exemple.

mon fichier contient 5366202 lignes. donc la recherche complete du fichier prend bcp de temps.
0
Réponse 4 / 16
jipicy Messages postés 40842 Date d'inscription jeudi 28 août 2003 Statut Modérateur Dernière intervention 10 août 2020 4 897
22 avril 2009 à 19:29
Je t'avoue que je ne comprends plus ;-(((

Avec ton exemple de fichier, effectivement il ne me renvoie rien avec "p;q" : 
[tmpfs]$ sed -n '/21622010039/p;q' plop
[tmpfs]$

Il me renvoie bien la ligne sans le "q" : 
[tmpfs]$ sed -n '/21622010039/p' plop
21622010039|14|


Par contre sur un autre fichier la commande "p;q" marche bien : 

[tmpfs]$ cat list.db
toto 0123456789
tata 0555555555
titi 0677775555
tutu 0123456789
tete 0123456789
bobo 0555555555
baba 0987654321
bibi 0555555555
bubu 0123456789

[tmpfs]$ sed -n '/01/p;q' list.db
toto 0123456789
[tmpfs]$
Je ne comprends pas ;-(((((

Désolé ;-(
0
userette
22 avril 2009 à 19:34
j'ai essayé ton exemple.
en fait, j'ai remarqué que avec sed -n '/01/p;q' list.db il recherche toujours ds la 1ere ligne et quit juste après.

si tu essayait sed -n '/05/p;q' list.db pour voir


stp ça m'aiderait bcp
0

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Réponse 5 / 16
jipicy Messages postés 40842 Date d'inscription jeudi 28 août 2003 Statut Modérateur Dernière intervention 10 août 2020 4 897
22 avril 2009 à 20:00
Effectivement avec une autre ligne que la 1ère ça marche plus ;-\

Bon on va creuser le sujet ;-))
0
Réponse 6 / 16
lami20j Messages postés 21331 Date d'inscription jeudi 4 novembre 2004 Statut Modérateur, Contributeur sécurité Dernière intervention 30 octobre 2019 3 567
22 avril 2009 à 20:32
Salut,

Avec perl (j'ai fait un doublon pour tester - voir en gras)
$ cat base
21621623335704|17|
21621623336802|17|
21621623351963|17|
21621623357067|17|
21621623373862|17|
21621623376968|17|
21621623390324|17|
21621623391903|17|
21622010039|14|
21622010039|14|
21622010077|16|
21622010191|36|
21622010275|16|
21622010352|16|
21622010405|18|
21622010547|14|
21622010664|37|
21622010692|17|
21622010709|36|
21622010720|17|
21622010737|17|
21622010822|37|
21622010944|36|
21622011017|14|
$ perl -ne 'next unless /^(21622010039)/;print "ligne $. => $1\n"' base
ligne 9 => 21622010039
ligne 10 => 21622010039
$ perl -ne 'next unless /^(21622010039)/;print "ligne $. => $1\n" and exit' base
ligne 9 => 21622010039
0
jipicy Messages postés 40842 Date d'inscription jeudi 28 août 2003 Statut Modérateur Dernière intervention 10 août 2020 4 897
22 avril 2009 à 20:39
Salut lami20j,

J'étais à 2 doigts de te demander une solution en Perl car apparemment avec "sed" ce n'est pas possible directement, à moins d'user de moulinettes contre productive ;-((

Merci ;-)

Sinon avec sed il faudrait connaitre au moins le contenu de la ligne suivante pour faire un truc du genre :
$ sed -n '/21622010077/q;/21622010039/p' plop
21622010039|14|
Avec ça ça marche ;-))

PS. Dommage quand même que le "grep -m 1" ne marche pas :
$ grep -m 1 '21622010039' plop
21622010039|14|
;-))
0
lami20j Messages postés 21331 Date d'inscription jeudi 4 novembre 2004 Statut Modérateur, Contributeur sécurité Dernière intervention 30 octobre 2019 3 567 > jipicy Messages postés 40842 Date d'inscription jeudi 28 août 2003 Statut Modérateur Dernière intervention 10 août 2020
22 avril 2009 à 21:09
Salut jipicy ;-)

De rien ;-))
0
Réponse 7 / 16
lami20j Messages postés 21331 Date d'inscription jeudi 4 novembre 2004 Statut Modérateur, Contributeur sécurité Dernière intervention 30 octobre 2019 3 567
22 avril 2009 à 21:08
Re,

Et comme ça?!
$ cat base
21621623335704|17|
21621623336802|17|
21621623351963|17|
21621623357067|17|
21621623373862|17|
21621623376968|17|
21621623390324|17|
21621623391903|17|
21622010039|14|
21622010039|14|
21622010077|16|
21622010191|36|
21622010275|16|
21622010352|16|
21622010405|18|
21622010547|14|
21622010664|37|
21622010692|17|
21622010709|36|
21622010720|17|
21622010737|17|
21622010822|37|
21622010944|36|
21622011017|14|
$ while read ligne;do echo $ligne|grep 21622010039 && break;done <base
21622010039|14|
0
userette
23 avril 2009 à 09:24
salut à tous,
merci pour toutes vos réponses.
j'aime bien la solution en perl. sauf que je ne m'y connais pas trop en perl.

lami20j, tu peux me dire comment j'extrais toute la ligne et non pas seulement le motif ??????

21622010039|14|


merciiiiiiiiiiiiii
0
userette > userette
23 avril 2009 à 09:28
meme avec le while read ...... grep "" && break, ça marche. superrrrrrr

vous me sauvez la vie :) :) :)
0
Réponse 8 / 16
lami20j Messages postés 21331 Date d'inscription jeudi 4 novembre 2004 Statut Modérateur, Contributeur sécurité Dernière intervention 30 octobre 2019 3 567
23 avril 2009 à 09:31
Salut,


Avec shell + grep
while read ligne;do echo $ligne|grep -o 21622010039 && break;done <base

En perl 
perl -ne 'next unless /^(21622010039)/;print "$1\n" and exit' base
0
Réponse 9 / 16
dubcek Messages postés 18744 Date d'inscription lundi 15 janvier 2007 Statut Contributeur Dernière intervention 4 septembre 2024 5 617
23 avril 2009 à 09:34
hello
et avec awk
awk '/21622010039/ {print $0;exit} < fichier
0
lami20j Messages postés 21331 Date d'inscription jeudi 4 novembre 2004 Statut Modérateur, Contributeur sécurité Dernière intervention 30 octobre 2019 3 567
23 avril 2009 à 09:38
Salut,

T'as pas oublié un apostrophe ? ;-)
0
userette > lami20j Messages postés 21331 Date d'inscription jeudi 4 novembre 2004 Statut Modérateur, Contributeur sécurité Dernière intervention 30 octobre 2019
23 avril 2009 à 09:43
lami20j c'est encore moi. désolée d'être aussi pressante mais c pour un truc urgent.

en fait, avec ta commande perl, je n'extrais que le motif. moi je voudrais toute la phrase.

t'aurais pas une idée !!
0
lami20j Messages postés 21331 Date d'inscription jeudi 4 novembre 2004 Statut Modérateur, Contributeur sécurité Dernière intervention 30 octobre 2019 3 567 > userette
23 avril 2009 à 09:55
Re,

Essaie
perl -ne 'next unless /^21622010039/;print and exit' base
--
106485010510997108
0
userette > lami20j Messages postés 21331 Date d'inscription jeudi 4 novembre 2004 Statut Modérateur, Contributeur sécurité Dernière intervention 30 octobre 2019
23 avril 2009 à 10:58
ok ça marche mnt sauf que si je mets ma commande dans un script : 

cat msisdn.txt | while read MSISDN
	do
		echo $MSISDN
		result=`perl -ne 'next unless /^$MSISDN/;print and exit' base`
		echo $result
	done


la commande marche mais ça me sort toujours la 1ere ligne du fichier base

base : 
21622010039|14|
21622010077|16|
21622010191|36|
21622010275|16|
21622010352|16|
21622010405|18|
21622010547|14|
21622010664|37|
21622010692|17|
21622010709|36|
21622010720|17|


msisdn.txt : 
21622010405
21622010664


bizarre !!!
0
Réponse 10 / 16
dubcek Messages postés 18744 Date d'inscription lundi 15 janvier 2007 Statut Contributeur Dernière intervention 4 septembre 2024 5 617
23 avril 2009 à 09:41
effectivement
awk '/21622010039/ {print $0;exit}' < fichier
0
Réponse 11 / 16
lami20j Messages postés 21331 Date d'inscription jeudi 4 novembre 2004 Statut Modérateur, Contributeur sécurité Dernière intervention 30 octobre 2019 3 567
23 avril 2009 à 11:12
Re, 

for MSISDN in $(cat msisdn.txt)
do
  echo $MSISDN
  result=$(perl -ne 'next unless /^$MSISDN/;print and exit' base)
  echo $result
done

Mais je ne comprends pas ce que tu veux.
Comment ça la 1ère ligne?!

Il faut que tu exécutes le script est affiche ici le résultat.
Il faudra aussi que tu affiches ce que tu veux obtenir.

En réalité, tu as posé une question pour un cas particulier, mais il s'avère que le problème doit être traiter de façon globale.

On attends tes explications.
0
userette
23 avril 2009 à 11:32
ok. j'ai essayé le code que tu as mis. mais j'ai toujours le même résultat non attendu, à savoir : 

21622010405
21622010039|14|
21622010664
21622010039|14|


==> la commande renvoie toujours la 1ere ligne du fichier base


alors que je veux avoir : 
21622010405
21622010405|18|
21622010664
21622010664|37|


==> extraire les 1eres lignes relatives aux motifs que je recherche.

any idea please ?
merci
0
Réponse 12 / 16
lami20j Messages postés 21331 Date d'inscription jeudi 4 novembre 2004 Statut Modérateur, Contributeur sécurité Dernière intervention 30 octobre 2019 3 567
23 avril 2009 à 11:36
Re,

Tu testes quoi en fait? L'affichage de ton résultat ne suffit pas.

Affiche le résultar de
for MSISDN in $(cat msisdn.txt);do  echo $MSISDN;done
0
userette
23 avril 2009 à 11:46
ah ok, j'avais pas compris.
j'avais mis plus haut le contenu de mon fichier : 
21622010405
21622010664
0
Réponse 13 / 16
userette
23 avril 2009 à 12:46
alors??
help please !! :(
je desespere
0
Réponse 14 / 16
userette
23 avril 2009 à 13:30
ok ça fonctionne mnt. j'ai juste remplacer les ' par les ". et bizarre ça marche mnt.
le pb c'est que la recherche est tjrs aussi lente.
je vais esaayer d'optimiser
0
Réponse 15 / 16
lami20j Messages postés 21331 Date d'inscription jeudi 4 novembre 2004 Statut Modérateur, Contributeur sécurité Dernière intervention 30 octobre 2019 3 567
23 avril 2009 à 13:33
Re,

Il peut avoir un conflit entre une variable shell et perl (je n'ai pas moyens de tester)

Essaie plutôt (je n'ai pas testé)
for MSISDN in $(cat msisdn.txt)
do
  echo $MSISDN
  while read ligne
  do 
      echo $ligne|grep $MSISDN && break
  done < base
done
0
Réponse 16 / 16
jipicy Messages postés 40842 Date d'inscription jeudi 28 août 2003 Statut Modérateur Dernière intervention 10 août 2020 4 897
23 avril 2009 à 14:46
Dis-moi userette, tu peux essayer ça :
 sed '/21622010039/!d;q' fichier
s'il te plait ;-))
0
userette
23 avril 2009 à 15:43
oui ça marche mais ça ne me renvoie pas toute la ligne. que le 21622010039
0
jipicy Messages postés 40842 Date d'inscription jeudi 28 août 2003 Statut Modérateur Dernière intervention 10 août 2020 4 897 > userette
23 avril 2009 à 15:51
Encore une bizarrerie ;-((

Essaie :
 sed '/21622010039.*$/!d;q'
0
userette > jipicy Messages postés 40842 Date d'inscription jeudi 28 août 2003 Statut Modérateur Dernière intervention 10 août 2020
23 avril 2009 à 18:03
finalement,
j'ai utilisé 
`perl -ne "next unless /^$chaine/;print and exit" base  >> output.txt`


ça marche.
merci à toi jipicy.

merci à tous :))))
0

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