Disque non reconnu par windows

Bonjour !
J'ai un pc infecté par quelques virus (systeme windows 2000) - Et pour désinfecté le disque dur, j'ai braché ce dernier sur un autre pc qui a un systeme windows 98 - Le probleme c'est que le disque infecté est bel et bien reconnu par le bios du 2eme pc mais non reconnu par windows 98 (il n'y a rien dans poste de travail sauf le disque c: du 2eme pc) - Qu'est ce qui se passe ? est ce un problème de système de fichier (peut être que l'un est ntfs et l'autre fat32) ?

Merci de votre réponse