Réinstallation et fichier de configuration

Bonjour,

J'ai une question toute simple!
Depuis longtemps que je me demande, sans trouver de réponse, ce qui se produit avec les fichiers de configuration lors d'une réinstallation. Je sais que plusieurs programmes laissent un dossier caché dans le home lors de leur utilisation. Si je réinstaller ma distribution sans toucher au /home qu'est-ce qui arrive avec ces fichiers caché???
Si je réinstalle les mêmes programmes vont-il se réinstaller avec l'ancienne configuration (celle du home que j'ai laissé intacte) ou vont-ils l'écraser??