Icônes Préférences Systèmes absentes de la barre de menu

Bonjour,

Suite à un changement de disque dur, toutes les icônes Apple des préférences systèmes sont absentes du menu : horloge, wifi, clavier, Time machine, etc. Bien sûr, les cases à cocher dans les panneaux Préférences Système le sont bien, mais soit se décochent toute seule immédiatement ou après quelques secondes, soit restent cochées mais sans effet… Seules les icônes non Apple sont visibles (Evernote par exemple)…

Quelques infos :
Je suis sous Mas OSX 10.9.5.
Après sauvegarde Time Machine, je remplace mon disque dur 750Go par un SSD 1T. Puis je réinstalle tout depuis la sauvegarde.
Tout se passe très bien, sauf dans le menu !

Réparer les autorisations (Utilitaire Disques), et même un passage par ONYX n'y ont rien fait.
Dans le dossier "HD -> Système -> Bibliothèque -> CoreServices -> Menu extras", les fichiers ".menu" sont bien présents.

Par ailleurs, certains raccourcis ne fonctionnent plus, notamment le "CMD-<" qui ne permets plus de passer d'un document à un autre au sein d'une application…

Voilà !
Que faire ?
Par avance, grand merci pour votre aide !

Bonne fin de journée.