PC qui rame de manière régulière

Bonjour,
J'ai besoin d'aide car mon PC rame de manière régulière, depuis quelques jours alors que je n'ai pas installé de nouveaux programmes ni changé de pièce.
Quelle que soit l'application (Internet, Word, un jeux...), fréquemment, le programme se fige, le curseur de la souris indique un temps de chargement, et ça se bloque pendant environ 30 secondes.
Tout ce que je peux faire, c'est réduire la fenêtre, même s'il arrive quelque fois que l'ordinateur freeze complètement pendant une minute.

J'ai d'abord pensé à un virus, mais des analyses de BitDefender et Malwarebytes n'ont rien donné. J'ai aussi utilisé HD Tunes, le diagnostic mémoire Windows l'outil "Vérification des erreurs" du C:, rien de particulier à signaler.
J'ai aussi néttoyé les fichiers temporaires et les cookies avec CCleaner, ça n'a rien changé.
J'ai nettoyé le registre avec. Il y a cependant un truc étrange : même si je n'installe ou désinstalle rien, j'ai deux lignes signalant une erreur qui revienne fréquemment, avec CCleaner, donc :

Classe de fichier vide ou invalide .pl\OpenWithProgids\pfile
HKCU\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\FileExts\.pl\OpenWithProgids

et

Extension de fichier inutilisée .pl
HKCU\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\FileExts\.pl

Je sais pas si c'est important de le signaler...
J'utilise Windows 7 64 bits et IE9, merci d'avance pour votre aide.