Conseil pour organiser mes fichiers

Bonjour,

Il y a peu de temps j'ai acheté un disque dur externe "my book essential" fix qui fait 1To car mon disque dur externe est plein (180g pour 175g utilisé) ce qui fais ramer mon PC,.J'aimerais savoir comment je pourrais organiser mes fichier; si il serait préférable de tout mettre sur le disque dur externe ou de mettre le moins important...
Si je met tout sur le disque dur externe pourra t'il y avoir un risque a ce que certain fichier ne fonctionne plus car ils sont plus sur le C: par exemple?

Si vous pourriez m'éclaircir un peu plus pour m'aider a transférer mes donnés en sécurité ce serait sympa, Merci :)