Petite question sur le Formatage d'un Disque

Bonjour, alors voila j'ai une question qui me turlupine j'ai un Pc qui est sous Windows Vista si par un jour je veux le restaurer en Usine chose qui est faisaisable via Recovery et les Dvd de Récupération système cela va t'il supprimer les données que j'ai sur le second disque dur en gros j'ai un disque dur qui contient Vista,un autre qui et une partition pour Recovery,et puis j'ai un autre Disque dur en Fat 32 ou je stock des Donnée sans importance vu que j'ai des double bref esque ce dernier disque sera affecté par la Restauration Usine?

je sais c'est une question Conne mais je voudrai savoir puisque sa me taquine l'esprit moi perso je pense pas mais je suis pas sur,merci a ceux ou celle qui pourront m'éclaircir cette zone d'ombre.