Indicador de arranque?

No tiene ninguna importancia / utilidad. De todas formas, Ubuntu te permite particionar y se encargará de todo durante la instalación. A priori, la única cosa bajo Windows es asegurarte de que no ocupe todo el disco y de dejar al menos 10 GiB para Ubuntu para que pueda instalarse (espacio no asignado en este punto).

Luego reinicias desde un CD de instalación de Ubuntu y te dejas guiar. Solo habrá que tener cuidado al particionar para no borrar tu Windows, diciéndole a Ubuntu que cree sus particiones en el espacio libre. Idealmente haz una partición manual.

Particionamiento clásico:
- 1 GiB para la swap (en swap)
- 9 GiB para / (en ext4)
- el resto para /home (en ext4) (a dimensionar según tus necesidades, es el equivalente a “Mis documentos”).

Si en total consigues con Windows más de 4 particiones, tendrás que crear tus particiones de Ubuntu en una partición extendida. Una partición extendida es simplemente una partición que se puede sazonar en subparticiones (las particiones lógicas o secundarias).

Buena suerte

Gracias por tu respuesta, tenía una duda sobre la historia del indicador de arranque. ;-)

Para la partición, como tengo un disco de 40Go pensé hacer:
- 1Gio para la swap (en swap)
- 20Gio para / (en ext4)
- el resto para /home (en ext4)

¿Va bien o es demasiado 20Go para la raíz?

Mi disco duro de Windows está particionado en 3 (C:, D:, E:).
¿Debo crear una partición extendida para Ubuntu sabiendo
que está en otro disco duro?

¿Va bien o es demasiado 20Go para la raíz?

Bah 10Go o 20Go... no cambia mucho hoy en día. Un linux en modo texto puro debe necesitar alrededor de 3Go, un modo gráfico bastante completo 5Go, un PC completo en unos 10Go. Con 20Go ya tienes un margen de reserva adicional.

De todas formas 10Go, 20Go hoy en día los discos son grandes así que puedes hacerte un capricho. Además una partición puede redimensionarse en caso de necesidad (cf e2resize). Cuando la máquina no tiene Windows, se puede usar LVM en lugar de MBR que permite hacer el café. Si tienes curiosidad:
http://doc.ubuntu-fr.org/lvm

¿ Debo crear una partición extendida para Ubuntu sabiendo
que está en otro disco duro ?

No, no; el límite de 4 particiones primarias se aplica solo por disco y se debe al modelo MBR. Una partición primaria puede ser

- una partición física (típicamente Windows debe estar instalado en una partición física)
- una partición extendida (que luego se dividirá en particiones lógicas o particiones secundarias).

te invito a leer esto:
http://doc.ubuntu-fr.org/partitions

Como Linux es un verdadero sistema operativo, puedes instalarlo sin problema sobre varias particiones lógicas de una partición extendida. Dado tu particionado actual no tienes opción. Bajo Windows debes ingeniártelas para hacer que tus tres particiones C:, D:, E: no cubran todo el disco.

Bajo Windows Vista y Windows 7 se puede redimensionar fácilmente una partición mediante el administrador de discos (clic derecho en Mi PC, administrar, administrador de discos). Es sobre ese espacio donde crearás tu partición extendida durante la instalación de Ubuntu. Esta partición extendida será dividida en tres particiones lógicas (el swap, /, /home).

En la práctica, nada impide distinguir / y /home, de igual manera se podría imaginar un Linux sin swap (si se tiene suficiente RAM, eso funciona). Eso permitiría reducir a 4 particiones y así no tener partición extendida. Pero eso sigue siendo arriesgado y no particionar así presenta inconvenientes (fsck largo, ¿qué hacer cuando ya no hay RAM, etc...). También te invito a instalar tu Linux en una partición extendida.

Bonne chance

Voy a repasar un poco los enlaces que me diste.
Muchas gracias por todas estas precisiones e información. ;-)

De nada y buena continuación :-)