Problème comparaison de fichiers

Bonjour,

Dans un script shell je lance une commande cft qui me remplit un fichier :
cftutil listcat >fichier1

puis je veux comparer ce fichier avec un autre fichier 2
sort fichier1 fichier2 |uniq -u >fichier3

Mais ça ne fonctionne pas, dans mon fichier3 j'ai des enregistrements en double.

Par contre c'est ce qui est étrange:

Si je remplis mon fichier1 à la main, ma compraison fonctionne très bien.

Est-ce que quelqu'un à une idée du problème que j'ai?

Je suis sous solaris