Bonjour,
j ai un shell scripte et je veux le convertir en perl
voici un exmeple de mon shell script mercii
#!/bin/sh
set -x
SDA_DISTR_DIR=/lapp_data/theorie/bioth/sda
SDA_EXE=sda_gfortran
SDA_KOFF_EXE=sda-koff_gfortran
APBS_EXE=/lapp_data/theorie/bioth/apbs-1.2-amd64/bin/apbs
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export SDA_DISTR_DIR
export SDA_EXE
export APBS_EXE
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cp -rf $PBS_O_HOME/1EEI/p1.* $TMPDIR
cp -rf $PBS_O_HOME/1EEI/p2.* $TMPDIR
cp -rf $PBS_O_HOME/1EEI/1EEI1 $TMPDIR
cd $TMPDIR/1EEI1/
ln -s p1.pdb.pqr p1h.pdb
ln -s p2.pdb.pqr p2h.pdb
cp p1.pdb.pqr tmp.pqr; $APBS_EXE p1.in > apbs1.ou; rm tmp.pqr;
$SDA_DISTR_DIR/bin/apbs2uhbd tmp.grd ep1.grd > apbs2uhbd.ou; rm tmp.grd;
cp p1h.pdb tmp.pdb; $SDA_DISTR_DIR/bin/mk_ed_grd < ed.in > ed1.ou; mv tmp.grd ed1.grd
cp p1h.pdb tmp.pdb; $SDA_DISTR_DIR/bin/mk_hd_grd <hd.in > hd1.ou; mv tmp.grd hd1.grd
cp p2.pdb.pqr tmp.pqr;$APBS_EXE p2.in > apbs2.ou; rm tmp.pqr;
$SDA_DISTR_DIR/bin/apbs2uhbd tmp.grd ep2.grd > apbs2uhbd.ou; rm tmp.grd;
cp p2h.pdb tmp.pdb; $SDA_DISTR_DIR/bin/mk_ed_grd < ed.in > ed2.ou; mv tmp.grd ed2.grd
cp p2h.pdb tmp.pdb; $SDA_DISTR_DIR/bin/mk_hd_grd < hd.in > hd2.ou; mv tmp.grd hd2.grd